Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mterf1bB9EJ57 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mterf1bB9EJ57 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mterf1bB9EJ57 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mterf1bB9EJ57 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mterf1bB9EJ57 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mterf1bB9EJ57 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Mterf1bB9EJ57 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Mterf1bB9EJ57 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mterf1bB9EJ57 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms