Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm5483B2RV77 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms