Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Prrt4B2RU40 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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