Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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