Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf518bB2RRE4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Znf518bB2RRE4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf518bB2RRE4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf518bB2RRE4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Znf518bB2RRE4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf518bB2RRE4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Znf518bB2RRE4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Znf518bB2RRE4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf518bB2RRE4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Znf518bB2RRE4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Znf518bB2RRE4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Znf518bB2RRE4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Znf518bB2RRE4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Znf518bB2RRE4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Znf518bB2RRE4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Znf518bB2RRE4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms