Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms