Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms