Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms