Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms