Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ism1A2ATD1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms