Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Patl2A2ARM1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms