Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms