Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms