Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms