Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbf1A2A870 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbf1A2A870 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms