Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms