Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
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