Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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