Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms