Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Uso1Q9Z1Z0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms