Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip6Q9Z1Y4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms