Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms