Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms