Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5Q9Z131 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms