Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Sema4fQ9Z123 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Sema4fQ9Z123 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4fQ9Z123 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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