Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ccl8Q9Z121 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ccl8Q9Z121 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ccl8Q9Z121 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ccl8Q9Z121 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ccl8Q9Z121 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ccl8Q9Z121 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ccl8Q9Z121 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ccl8Q9Z121 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ccl8Q9Z121 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ccl8Q9Z121 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ccl8Q9Z121 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ccl8Q9Z121 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ccl8Q9Z121 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccl8Q9Z121 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccl8Q9Z121 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms