Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup160Q9Z0W3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup160Q9Z0W3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms