Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cldn3Q9Z0G9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cldn3Q9Z0G9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cldn3Q9Z0G9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cldn3Q9Z0G9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cldn3Q9Z0G9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cldn3Q9Z0G9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cldn3Q9Z0G9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cldn3Q9Z0G9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn3Q9Z0G9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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