Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PapolbQ9WVP6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PapolbQ9WVP6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PapolbQ9WVP6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PapolbQ9WVP6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PapolbQ9WVP6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms