Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms