Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms