Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms