Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms