Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nphp1Q9QY53 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms