Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms