Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptf1aQ9QX98 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms