Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dkk3Q9QUN9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms