Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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