Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l2Q9JLG4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms