Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FancaQ9JL70 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
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FancaQ9JL70 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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FancaQ9JL70 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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FancaQ9JL70 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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FancaQ9JL70 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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FancaQ9JL70 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FancaQ9JL70 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms