Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp4Q9JIL5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms