Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ccl28Q9JIL2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ccl28Q9JIL2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl28Q9JIL2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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