Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cldn12Q9ET43 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cldn12Q9ET43 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cldn12Q9ET43 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cldn12Q9ET43 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Cldn12Q9ET43 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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