Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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