Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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