Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms