Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Slc28a3Q9ERH8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Slc28a3Q9ERH8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Slc28a3Q9ERH8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Slc28a3Q9ERH8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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