Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhojQ9ER71 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
RhojQ9ER71 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhojQ9ER71 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhojQ9ER71 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhojQ9ER71 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhojQ9ER71 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhojQ9ER71 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RhojQ9ER71 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhojQ9ER71 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhojQ9ER71 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RhojQ9ER71 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhojQ9ER71 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RhojQ9ER71 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhojQ9ER71 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhojQ9ER71 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms