Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms