Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms